單細胞全轉(zhuǎn)錄組測序新技術(shù)邁入新階段
2014年4月29日,生物動態(tài)光學(xué)成像中心黃巖誼、湯富酬課題組在《美國科學(xué)院院刊》(PNAS)上發(fā)表題為Microfluidic single-cell whole-transcriptome sequencing的論文。該研究利用微流控芯片技術(shù)實現(xiàn)了高質(zhì)量單細胞的全轉(zhuǎn)錄組測序樣品準(zhǔn)備,全面提高了單細胞全轉(zhuǎn)錄組分析的準(zhǔn)確性和可靠性。
單細胞測序利用新一代的測序技術(shù)來分析單個細胞內(nèi)的基因信息,成為解讀單細胞的最佳工具。單細胞全轉(zhuǎn)錄組測序是單細胞高通量測序需求量最大的應(yīng)用,它所測定的是單個細胞內(nèi)所有基因的表達量,同時還可以測定除了mRNA分子外,其他長非編碼rna(lncRNA) 以及小RNA的含量,定量獲取單個細胞完整的表達譜。目前采用的新一代測序技術(shù)中,絕大多數(shù)方法都需要特定的前處理過程,制備“測序文庫”。而針對單細胞 樣品,已有的方法均存在很多缺陷,導(dǎo)致檢測靈敏度不高、基因表達信息丟失嚴(yán)重、技術(shù)噪音高、操作失誤率高、重復(fù)性差。
|
![]() |
通過多個細胞較低深度的轉(zhuǎn)錄組測序,可以獲取比同等成本下單個細胞高深度測序更 重要的細胞異質(zhì)性信息,而更好地展現(xiàn)生物體系的復(fù)雜性、隨機性和動態(tài)過程。而通過微流控芯片上的精確細胞操控和主動俘獲過程,還可以擺脫其他類似方法中隨 機俘獲的局限性,實現(xiàn)對極其少量細胞的完全俘獲和反應(yīng)前的表型觀察,以更好地理解和驗證單個細胞的異質(zhì)性。與已有的技術(shù)相比,這一工作展示了目前最好的單 細胞轉(zhuǎn)錄組測序檢測靈敏度和平行性。 |