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麻省理工學(xué)院微流控術(shù)同時精確測量多個細(xì)胞體重

最近,美國麻省理工學(xué)院(MIT)發(fā)明的一種新技術(shù),可以同時精確地測量許多單細(xì)胞的生長。這一進(jìn)展有望帶來快速的藥物測試,對“更大細(xì)胞群體中單個細(xì)胞之間的生長差異”提供了新的見解,并有助于跟蹤不斷變化的環(huán)境條件下的細(xì)胞動態(tài)生長。這一技術(shù)發(fā)表在《Nature Biotechnology》雜志


這種技術(shù)利用大量的懸浮微孔道諧振器(SMR)——一種微流控裝置,可測量流經(jīng)微孔道的大多數(shù)細(xì)胞。一種新的設(shè)計使該設(shè)備的通量增加了近兩個數(shù)量級,同時保持精確度。2012年,他們在之前研發(fā)的一個微流控設(shè)備(暫停通道諧振器SMR,用來檢測細(xì)胞的重量)的基礎(chǔ)上,進(jìn)行了大規(guī)模改動,將其用于細(xì)胞周期檢測,可以分析單個細(xì)胞在經(jīng)過100小時生長后多代的情況。在今年1月份,他們通過將復(fù)雜的RNA測序技術(shù)與分離單個細(xì)胞及其后代的新裝置相結(jié)合,可追蹤來自一個“祖先”的幾代細(xì)胞的詳細(xì)譜系。相關(guān)研究結(jié)果發(fā)表在《Nature Communications》。


在這項新的研究中,研究人員使用該設(shè)備來觀察抗生素和抗菌肽對細(xì)菌的影響,并指出細(xì)胞群體中單個細(xì)胞的生長變化,這具有重要的臨床應(yīng)用價值。例如,生長較慢的細(xì)菌有時會對抗生素產(chǎn)生耐藥性,并可能導(dǎo)致復(fù)發(fā)性的感染。


麻省理工學(xué)院生物工程和機(jī)械工程系教授Manalis表示:“該設(shè)備對于細(xì)胞如何生長并對藥物產(chǎn)生反應(yīng),提供了新的見解。”該論文的第一作者是Nathan Cermak——最近從麻省理工學(xué)院計算和系統(tǒng)生物學(xué)項目畢業(yè)的博士生,和Selim Olcum——Koch研究所的科學(xué)家。其他13名共同作者來自于Koch研究所、MIT微系統(tǒng)技術(shù)實驗室、Dana-Farber癌癥研究所、Innovative Micro Technology和CEA LETI。


Manalis和他的同事們在2007年首次開發(fā)了SMR,后來推出了多種創(chuàng)新用于不同的目的,包括隨時間的推移跟蹤單個細(xì)胞的生長、測量細(xì)胞密度、稱量細(xì)胞分泌的囊泡,就在最近,測量不斷變化的營養(yǎng)條件下細(xì)胞的短期生長反應(yīng)。


所有這些技術(shù)都依賴于一個關(guān)鍵的方案:一條充滿液體的微通道,被蝕刻在一個微小的硅懸臂梁傳感器上,它在一個真空腔中震動。當(dāng)一個細(xì)胞進(jìn)入懸臂梁時,它會稍微改變傳感器的振動頻率,這個信號可以用來確定細(xì)胞的重量。它們就像稱重站,當(dāng)每個細(xì)胞流經(jīng)這個郵票大小的設(shè)備時,它會記錄每個細(xì)胞的質(zhì)量。在每個傳感器之間是彎曲的“延遲通道”,每一個長度約五厘米,細(xì)胞流經(jīng)它的時間約為兩分鐘,從而使它們在到達(dá)下一個傳感器之前有時間生長。當(dāng)一個細(xì)胞退出一個傳感器時,另一個細(xì)胞可以進(jìn)入,從而增加了設(shè)備的吞吐量。這些結(jié)果顯示了每個傳感器上的每一個細(xì)胞的質(zhì)量,將它們生長或縮小的程度用圖形繪制出來。


傳統(tǒng)的抗生素測試需要培養(yǎng)細(xì)菌,這可能需要一天或更多的時間。使用這種新的設(shè)備,在一個小時內(nèi),研究人員就能記錄下細(xì)胞積累質(zhì)量的變化率。記錄時間減少,是測試藥物對抗臨床細(xì)菌感染的關(guān)鍵,Manalis說:“在某些情況下,有一個快速檢測法用于選擇抗生素,可使患者生存率帶來重大的變化。”



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